近日，广东省微生物研究所谢黎炜团队联合广州中医药大学方坚松团队在《Frontiers in Pharmacology》上发表了题为：TCMIO: A Comprehensive Database of Traditional Chinese Medicine on Immuno-Oncology 的研究论文。
该研究构建了中药肿瘤免疫数据库TCMIO（tcmio.xielab.net），数据库包括从文献中收集的400个肿瘤免疫靶点以及对应的126972个配体分子；来自中国药典的618味中药和1493味复方制剂；中药对应的16437个化学成分。这些数据及其相互关联数据存储在PostgreSQL数据库中，并做成在线网站提供在线浏览和下载。除此之外，网站提供Structure和MOA两个核心功能，Structure模块主要是针对配体和化学成分进行化学结构搜索，包括子结构、全结构和相似度搜索；MOA模块主要是针对中药和复方制剂进行网络药理学机制阐释模块，通过输入中药或者复方名称，建立中药-成分-靶点网络，同时这些靶点会利用DAVID进行KEGG通路富集。数据库中所有数据都可以在下载页面下载，也可以通过API形式访问获取。三、Sci Adv | 首次证实哺乳动物miRNA前体可编码多肽，且可有效治疗自身免疫病近年来的研究表明一些非编码基因（如lncRNA、circRNA）含有的微小开放读码框具有编码多肽的能力，并且这些多肽能够调控细胞生理活动。miRNA，是一类由内源基因编码的非编码单链RNA分子，是被最广泛和最深入研究的非编码RNA，miRNA在体内存在多种形式，最原始的是pri-miRNA，经过一次加工后，成为pre-miRNA（即miRNA前体），再经过Dicer酶酶切后，成为成熟miRNA。miRNA前体一般被认为不具备编码功能，2015年，法国图卢兹大学的研究人员在《Nature》发表论文，发现植物拟南芥中存在miR-165a及miR-171b前体编码多肽调控拟南芥根部的发育。但在哺乳动物中是否存在miRNA前体编码多肽的现象，仍有待于进一步的研究。近日，上海交通大学医学院/上海市免疫学研究所王宏林团队在《Science Advances》上发表了题为：A Micropeptide Encoded by LncRNA MIR155HG Suppresses Autoimmune Inflammation via Modulating Antigen Presentation 的研究论文。该研究报道了课题组原创性发现人树突状细胞中miRNA155 host gene存在编码多肽的潜能，并通过CRISPR基因编辑技术、定制抗体检测等，证实了该多肽的存在，并将这一多肽命名为miPEP155。进一步研究表明，miPEP155能够调控炎症环境中树突状细胞的抗原提呈能力，对小鼠类银屑病与多发性硬化症（EAE）两种自身免疫性疾病模型具有较好的治疗效果，这一多肽有望成为治疗自身免疫性疾病的创新性药物。四、Nat Genetics | 斯坦福大学医学院团队揭示多种转移性肿瘤的克隆起源和扩散时间转移是导致大部分（大约90%）癌症病人治疗失败和死亡的原因。近年来利用高通量肿瘤基因组测序数据，计算生物学家可以重构肿瘤的突变积累和克隆演化过程。然而，相比于原发性肿瘤，人们对于转移性肿瘤的基因组突变和克隆演化过程的了解还很缺乏，限制了临床上对于转移的早期预防和治疗。近日，美国斯坦福大学医学院的Christina Curtis团队在《Nature Genetics》上在线发表了题为：Multi-cancer analysis of clonality and the timing of systemic spread in paired primary tumors and metastases 的研究文章。（中科院深圳先进技术研究院合成生物学研究所胡政研究员为本文一作）
五、Biomaterials | 纳米疫苗与基因介导的细胞外基质清除剂相联合以实现肿瘤免疫肿瘤疫苗的抗肿瘤效果往往受到T细胞响应弱和活化的T细胞浸润差等问题的限制。近日，中科院长春应化所田华雨研究员和陈学思院士合作在《Biomaterials》发表了题为：Synergistic tumor immunological strategy by combining tumor nanovaccine with genemediated extracellular matrix scavenger 的研究论文。该研究设计了一种新的协同策略，以同时克服这两个障碍，进而实现增强肿瘤消除。为了诱导T细胞的强烈反应，实验设计了一种基于逐步静电相互作用的肿瘤纳米疫苗，该双功能递送系统PEI/CaCO3不仅可以作为疫苗载体以吸附抗原卵白蛋白（OVA）和佐剂（CpG），也可辅助激活骨髓来源的树突状细胞（BMDCs），因此，该PEI/CaCO3/OVA/CpG疫苗（NVs）可在体内同时实现BMDCs的活化和T细胞特异性反应的显著增强。为了增强活化的T细胞在肿瘤部位的浸润，实验构建了PEG/PEI/pSpam1 NPs，可在肿瘤部位实现HAase的高表达，进一步降解肿瘤细胞外基质以促进免疫细胞的浸润。同时，细胞外基质的降解也会增加血液灌注，缓解肿瘤乏氧和调节免疫抑制微环境。NVs与pSpam1@NPs的联合应用可显著提高抗肿瘤效率，并有效预防肿瘤复发。
参考文献：
[1] Yanling Wu, et al., Identification of Human Single-Domain Antibodies against SARS-CoV-2. Cell Host & Microbe. 2020.
[2] Zhihong Liu, et al., TCMIO: A Comprehensive Database of Traditional Chinese Medicine on Immuno-Oncology. Frontiers in Pharmacology. 2020.
[3] Liman Niu, et al., A Micropeptide Encoded by LncRNA MIR155HG Suppresses Autoimmune Inflammation via Modulating Antigen Presentation. Science Advances. 2020.
[4] Zheng Hu, et al., Multi-cancer analysis of clonality and the timing of systemic spread in paired primary tumors and metastases. Nature Genetics. 2020.
[5] Yingying Hu, et al., Synergistic tumor immunological strategy by combining tumor nanovaccine with genemediated extracellular matrix scavenger. Biomaterials. 2020.
科研速递 | 抗新冠全人源纳米抗体、中药肿瘤免疫数据库、转移性肿瘤的克隆起源和扩散时间等一文读全！
发布时间：2020-05-22 14:38 文章来源：未知 作者：凯发k8国际首页登录
Medical Research
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同时，具有悠久历史的传统中药，具有调节机体免疫与抗肿瘤方面效果。如人参中人参皂苷类成分，被广泛研究并发现对人体的免疫系统具有显著调节作用，此外，灵芝、黄芪、补骨脂等传统中药都发现具有类似调节作用。
鉴于目前肿瘤免疫靶点数据和小分子配体数据的日益增长以及中药的免疫调节作用，非常有必要系统性研究肿瘤免疫的靶点及其配体以及探索中药在肿瘤免疫中的潜在价值。
近日，广东省微生物研究所谢黎炜团队联合广州中医药大学方坚松团队在《Frontiers in Pharmacology》上发表了题为：TCMIO: A Comprehensive Database of Traditional Chinese Medicine on Immuno-Oncology 的研究论文。
该研究报道了对136例转移性结直肠癌、肺癌和乳腺癌基因组测序数据（原发/转移配对样品，共457个肿瘤样品）的分析结果，利用创新的计算方法，揭示了转移的克隆起源、扩散时间及治疗对转移发生过程的影响。
参考文献：
[1] Yanling Wu, et al., Identification of Human Single-Domain Antibodies against SARS-CoV-2. Cell Host & Microbe. 2020.
[2] Zhihong Liu, et al., TCMIO: A Comprehensive Database of Traditional Chinese Medicine on Immuno-Oncology. Frontiers in Pharmacology. 2020.
[3] Liman Niu, et al., A Micropeptide Encoded by LncRNA MIR155HG Suppresses Autoimmune Inflammation via Modulating Antigen Presentation. Science Advances. 2020.
[4] Zheng Hu, et al., Multi-cancer analysis of clonality and the timing of systemic spread in paired primary tumors and metastases. Nature Genetics. 2020.
[5] Yingying Hu, et al., Synergistic tumor immunological strategy by combining tumor nanovaccine with genemediated extracellular matrix scavenger. Biomaterials. 2020.